Vücutta salgılanan kimyasallar, kişinin birbirinden farklı duygular yaşamasında etkilidir. Vücut faaliyetlerini, ruh halini ve duygu durumlarını etkileyen serotonin, endorfin gibi kimyasallar beyin ve bağırsaklarda bulunur. Yani bağırsaklar, aynı beyin gibi ruh sağlığı ve davranışlar üzerinde etkilidir. Yaklaşık 20-30 yıl öncesine kadar bağırsağın sindirim sisteminin son parçası olduğu ve sadece boşaltım işlevi gördüğü düşünülüyordu; ancak bağırsağın duyguları ve davranışları etkilediğine dair kanıtlar vardır ve bu konuda araştırmalar devam etmektedir. Bağırsak, vücudumuzdaki diğer organlardan farklı olarak kendi kararını kendisi vererek bağımsız olarak faaliyetini gösterebilir. Sağlıklı bir beyin için, bağırsak sisteminin de sağlıklı olması gerekmektedir. Hem bağırsak hem de beyin aynı doku kümesinden meydana gelmiştir.

Bağırsaklar, endişe ve korku gibi duygularla bağlantılıdır. Kaygı bozuklukları ve duygu durum bozuklukları gibi hastalıklarda kişide meydana gelen olumsuz düşünceler sebebiyle mide ve bağırsak çabuk etkilenen organlardır. Örneğin, toplum önünde bir sunum yapacak olan kişinin stres yaşamasi ve karnının ağrıması bu durumda sık duyulan şikayetler arasındadır.

Mutluluk hormonu olarak bilinen serotoninin büyük bir kısmı bağırsaklarda üretilir. Serotonin eksikliğinde kişi kendisini depresif, stresli ve yorgun hisseder. Serotonin düzeyindeki düşüklük depresyona yol açabilir. Kişinin tükettiği besinlerle, kendisini mutlu veya mutsuz hissetmesi arasında bir ilişki vardır. Doğru bir beslenme düzeni, serotonin düzeyinin artmasını sağlar. Bu da doğrudan kişinin duygu durumunu olumlu yönde etkiler. Araştırmalara göre meyve ve sebze tüketmek kişinin daha mutlu hissetmesinde etkilidir. Ayrıca bağırsak bakterilerini arttırmak için doğal olmayan işlenmiş gıdalardan uzak durmak ve fermente yiyecekler (ev yoğurdu, lahana turşusu vb.) tüketmek, ruh sağlığını olumlu yönde destekler.

Stresli dönemlerde bağırsaktaki probiyotik bakterilerinin sayısı azalır. Bu nedenle doğal probiyotik ürünler tüketmek, bu bakterilerin sayısının artmasına ve bağırsak sisteminin düzenli çalışmasını sağlayarak, kişinin yaşadığı stres seviyesini azaltır.